Grazie ma alla fine ho risolto così:
1) Ho disinstallato ibooks e l'ho reinstallato senza avviarlo.
2) Ho installato "iBook fix 2" dalla repo http://repo.insanelyi.com e riavviato.
3) Ho disabilitato la connessione (sia wifi che 3G).
4) Ho quindi avviato iBooks senza essere connesso, bypassando cosí il controllo online.
5) Ho attivato la connessione ad internet ed usato il mio iPad senza nessun crash su ibooks.
Grazie per avermi aiutato