Dei segni rimangono e il rischio di ban c'è sempre, però ripristinando la nand originale forse eviti il ban, ma non è garantita la cosa... Oltre al ban c'è anche il rischio di brick e di perdere i dati che hai attualmente sulla Switch.
No, le mod sono tutte uguali e lavorano tutte nella stessa maniera, quindi non ce n'é una più sicura e meno invasiva...
Sinceramente ti sconsiglio di effettuare la mod alla Switch, rischi di compromettere completamente la componente online della console...